電子專用發票可以抵稅。
增值稅電子專用發票屬于增值稅專用發票，其法律效力、基本用途、基本使用規定等與增值稅紙質專用發票相同。目前包括通行費電子普通發票和購進國內旅客運輸服務取得的增值稅電子普通發票的行業可以抵扣。如取得的通行費電子發票，左上角沒有“通行費”字樣，“稅率”欄顯示“不征稅”、“稅額”不顯示金額的通行費電子發票，屬于不征稅發票，不得申報抵扣。
常見的可以抵扣增值稅銷項稅額的發票有：
1、取得的通行費電子發票可以計算抵扣；
2、取得的旅客運輸發票，機票，火車票可以計算抵扣；
3、從銷售方或者提供方取得的增值稅專用發票（含稅控機動車銷售統一發票）；
4、從海關取得的海關進口增值稅專用繳款書；
5、農產品收購發票或者銷售發票。
增值稅電子專用發票，屬于增值稅專用發票，其法律效力、基本用途、基本使用規定等與增值稅紙質專用發票相同。
1、形式上的區別：
電子發票就是電子形式的發票；
增值稅發票是紙質的發票，分為增值稅普通發票和增值稅專用發票；
2、抵扣上的區別：
電子發票原來屬于普通發票，現在也有了電子專用發票；
不論是紙質專票、還是電子專用發票，都可以抵扣；
3、取得方式的區別：
電子發票是通過電子發票服務平臺查詢、下 載取得的；
傳統紙質發票是銷售方直接開出來、購買方拿到的；
電子發票與傳統發票的區別主要有兩點：一是從傳統的物理介質發展為數據電文形式，二是打破了紙質發票作為會計記賬憑證的傳統，具備了發票會計檔案電子記賬的條件。
【法律依據】
《中華人民共和國發票管理辦法》
第七條 增值稅專用發票由國務院稅務主管部門確定的企業印制；其他發票，按照國務院稅務主管部門的規定，由省、自治區、直轄市稅務機關確定的企業印制。禁止私自印制、偽造、變造發票。?

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